Première partie: Rencontre entre Akatsuki, les Nukenins et d'autres ninjas d'élite !
Itachi, le frère de Sasuke avait il y a longtemps, tué pratiquement tous les membres de son clan, a part Sasuke. Mais après de paisibles moments, Sasuke apprit que d'autres shinobis de son clan avaient été épargné. Il s'agissait de Raito Uchiwa, genin de Kiri Gakure et de Tobi Uchiwa, membre de l'akatsuki. Il était intrigué et alla à la recherche de Raito. Il le rejoignit Raito à Kiri et créa un groupe de 4 shinobis, dont Raito, Shino Hiyori et lui fesaient partie. Sur ce, il se dirigea vers la frontière qui se trouve entre Suna et Konoha. Il savait plus ou moins où se trouvait l'akatsuki et s'est pour cela qu'il était allé à cet endroit.
Deux membres de l'organisation furent intéressé par le bijûu de Hiyori et s'amenèrent en direction du petit groupe. Il s'agissait de Akasune no Sasori et de Tobi Uchiwa. Puis deux ninjas déserteurs de Kiri Gakure arrivèrent sur le terrain de combat. Le premier s'appelait Zabuza Momochi, le démon du brouillard et le duxième Ellie Uchiwa, la jeune fille ayant déserté Kiri.